La gouvernance de Colas Rail est organisée de la façon suivante :
- Un Président, Hervé Le Joliff définit et assure la mise en œuvre des orientations stratégiques ainsi que les objectifs qui en découlent.
- 3 Directeurs Généraux Adjoints ont la responsabilité de la gestion des opérations par région : France & Europe sous la direction de Jean-François Milleron, international sous la direction de Jérôme Bellemin et UK sous la direction de Jean-Pierre Bertrand.
- Un Directeur Général Adjoint, Jean de La Chapelle, a en charge les fonctions supports opérationnelles.
- Les autres fonctions support Sécurité & Sûreté, Ressources Humaines, Administration et Finances, Juridique et Business Développement sont quant à elles gérées par des Directeurs de filière & rattachées au Président.